三千院では年初にあたり、ご本尊のお薬師様に、私たちがこれまで犯した三業（身、口、意）の罪や過ちを懺悔し、国家安穏、天下泰平を祈り、今年もまた無事に過ごせるようにと祈願する修正会が営まれます。修正会は、あやまった行いを改め、正しい行いをするという「翻邪（ほんじゃ）」修正の意味から名づけられました。その年の生活目標を立てて心新たにし、求道の生活に進む決意をする日でもあり、出仕の僧侶により「法華三昧」という声明（仏教音楽）が唱えられます。